কুতুবপুর ইউনিয়ন বাংলাদেশের ঢাকা বিভাগের মাদারীপুর জেলার শিবচর উপজেলার একটি ইউনিয়ন যা ৬৩টি গ্রাম নিয়ে গঠিত। কুতুবপুর ইউনিয়নের উপর দিয়ে পদ্মা নদীর শাখা প্রবাহিত হয়েছে। কুতুবপুর ইউনিয়নের মোট আয়তন ৩,৭৭৫ একর বা ১৫.২৮ বর্গ কিলোমিটার।। গ্রামের সংখ্যা ৬৩টি। ঘরবাড়ির সংখ্যা ৩,৮০২টি।